В файловом менеджере при появлении ошибки «Конвертация в UTF-8 не поддерживается на стороне сервера» нужно открыть файл /usr/local/ispmgr/etc/ispmgr.conf и добавить туда

FSEncoding UTF-8

Далее нужно перезагрузить ispmanager

killall ispmgr